根據(jù)配制原料分類

天然培養(yǎng)基

利用動物、植物或微生物體（包括其提取物）制成

難以確切知道其化學成分，但一般營養(yǎng)豐富，微生物生長旺盛，而且來源廣泛，配制方便，所以較為常用，尤其適合于配制實驗室常用的培養(yǎng)基和大生產上的培養(yǎng)基。穩(wěn)定性常受生產廠或批號等因素的影響。

合成培養(yǎng)基

根據(jù)天然培養(yǎng)基的成分，用化學物質模擬合成、人工設計而配制

用已知化學成分的化學藥品配制而成，化學成分精確、重復性強，但價格昂貴，而微生物又生長緩慢，適用于做一些科學研究，例如營養(yǎng)、代謝的研究。

半合成培養(yǎng)基

主要以化學試劑配制，同時還加有某種或某些天然成分

在合成培養(yǎng)基中，加入某種或幾種天然成分；或者在天然培養(yǎng)基中，加入一種或幾種已知成分的化學藥品即成半合成培養(yǎng)基。

根據(jù)物理形態(tài)分類

固體培養(yǎng)基

在培養(yǎng)基中加入凝固劑，有瓊脂、明膠、硅膠等。

常用于微生物分離、鑒定、計數(shù)和菌種保存等方面。

半固體培養(yǎng)基

在液體培養(yǎng)基中加入少量凝固劑而呈半固體狀態(tài)。

可用于觀察細菌的運動、鑒定菌種和測定噬菌體的效價等方面。

液體培養(yǎng)基

不加任何凝固劑。成分均勻，微生物能充分接觸和利用培養(yǎng)基中的養(yǎng)料。

適于作生理等研究，由于發(fā)酵率高，操作方便，也常用于發(fā)酵工業(yè)。

根據(jù)營養(yǎng)成分分類

基本培養(yǎng)基（最低限度培養(yǎng)基）

只能保證某些微生物的野生型菌株正常生長，是含有營養(yǎng)要求最低成分的合成培養(yǎng)基。

往往缺少某些生長因子，所以經過誘變過的營養(yǎng)缺陷型菌株不能生長。

完全培養(yǎng)基（血清細胞培養(yǎng)基）

基本培養(yǎng)基中加入血清、富含氯基酸、維生素和堿基之類的天然物質（如酵母浸出物、蛋白胨等），即加入生長因子而成完全培養(yǎng)基。

可用來滿足微生物的各種營養(yǎng)缺陷型菌株的生長需要。

補充培養(yǎng)基

往基本培養(yǎng)基中有針對性加進某一種或某幾種該菌株不能合成的營養(yǎng)因子而組成。

滿足相應的營養(yǎng)缺陷型菌株生長的需要。